Home | Browse CottonDB | Quick Queries | FPC Viewer | Genome Browser | BLAST Server |
| Map Summaries | Maps | Feature Search | Matrix | Map Sets | Species | Help | Tutorial

 

Welcome to the Matrix

Each cell in the matrix shows the number of correspondences (and maps) between each pair. A correspondence is any relationship between two features.

Restrict Reference Sets By:         Use Colors Hide Empty Rows
Reference Set Bin Genetic Reference Reference Set
AD:Gh/Gb AD:Gb/Gh AD:Gh/Gb AD:Gh/Gh AD:Gh/Gto A:Gar/Gar A:Gar/Ghe A:Ghe/Gar D:Gtr/Gra G:Gne/Gau AD:Ref_Map
  Monsanto SSR Bin Map 3-79 x NM-24016, RIL (2008) Hai-7124 x Junmian-1, BC1 (2008) Hai-7124 x Junmian-1, F2 (2008) Pima S-7 x Empire, F2 (2007) Pima S-7 x im, F2 (2007) Pima S-7 x n2, F2 (2007) Acala-44 x Pima S-7, F2 (2004) CCRI-36 x Hai-7124 ,F2 (2007) CAMD-E x Seaberry, F2 (1998) Deltapine x Giza-83, F2 (2008) Deltapine-61 x Seaberry, F2 (2000) Emian-22 x 3-79, BC1 (2008) Guazuncho-2 x VH8-4602, BC1 (2005) Guazuncho-2 x VH8-4602, BC2 (2006) Handan-208 x Pima-90, F2 (2007) Palmeri x K-101, F2 (2007) Sic'on x F-177, F2 (2004) TM-1 x 3-79, RIL (2006) TM-1 x Hai-7124, BC1 (2007) Tamcot-2111 x Pima S-6, BC3F2 (2005) Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2002) Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2005) Xinluzao-1 x Hai-7124, F2 (2008) 7235 x TM-1, RIL (2007) DES 119-5 x MD51ne, F2,3 (2002) Deltapine-61 x Texas-701, F2 (2007) HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) HS-46 x MARCABUCAG8US-1-88, F2,3 (1998) MD-5678ne x Prema, F2,3 (2000) (Simian-3 x Sumian-12) x (Zhong-4133 x 8891), 4WC (2008) Yumian-1 x T586, F2:3 (2005) Zhongmiansuo-12 x 8891, RIL (2007) TM-1 x WT-936, F2 (2005) Jiang-Ling-Zhong-Mian x Zhe-Jiang-Xiao-Shan-Lu-Shu, F2 SMA-4 x A1-97, F2 (2005) A1-97 x A2-47, F2 (1999) Gt x Gr, F2 (2004) Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-a (2003) Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-n (2003) Ref_map  
Reference AD:Ref_Map
Ref_map 		Ref-chr1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr1 AD:Ref_Map
Ref_map 		Reference
Ref-chr10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr10
Ref-chr11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr11
Ref-chr12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr12
Ref-chr13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr13
Ref-chr14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr14
Ref-chr15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr15
Ref-chr16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr16
Ref-chr17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr17
Ref-chr18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr18
Ref-chr19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr19
Ref-chr2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr2
Ref-chr20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr20
Ref-chr21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr21
Ref-chr22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr22
Ref-chr23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr23
Ref-chr24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr24
Ref-chr25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr25
Ref-chr26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr26
Ref-chr3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr3
Ref-chr4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr4
Ref-chr5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr5
Ref-chr6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr6
Ref-chr7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr7
Ref-chr8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr8
Ref-chr9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Ref-chr9
  Monsanto SSR Bin Map 3-79 x NM-24016, RIL (2008) Hai-7124 x Junmian-1, BC1 (2008) Hai-7124 x Junmian-1, F2 (2008) Pima S-7 x Empire, F2 (2007) Pima S-7 x im, F2 (2007) Pima S-7 x n2, F2 (2007) Acala-44 x Pima S-7, F2 (2004) CCRI-36 x Hai-7124 ,F2 (2007) CAMD-E x Seaberry, F2 (1998) Deltapine x Giza-83, F2 (2008) Deltapine-61 x Seaberry, F2 (2000) Emian-22 x 3-79, BC1 (2008) Guazuncho-2 x VH8-4602, BC1 (2005) Guazuncho-2 x VH8-4602, BC2 (2006) Handan-208 x Pima-90, F2 (2007) Palmeri x K-101, F2 (2007) Sic'on x F-177, F2 (2004) TM-1 x 3-79, RIL (2006) TM-1 x Hai-7124, BC1 (2007) Tamcot-2111 x Pima S-6, BC3F2 (2005) Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2002) Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2005) Xinluzao-1 x Hai-7124, F2 (2008) 7235 x TM-1, RIL (2007) DES 119-5 x MD51ne, F2,3 (2002) Deltapine-61 x Texas-701, F2 (2007) HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) HS-46 x MARCABUCAG8US-1-88, F2,3 (1998) MD-5678ne x Prema, F2,3 (2000) (Simian-3 x Sumian-12) x (Zhong-4133 x 8891), 4WC (2008) Yumian-1 x T586, F2:3 (2005) Zhongmiansuo-12 x 8891, RIL (2007) TM-1 x WT-936, F2 (2005) Jiang-Ling-Zhong-Mian x Zhe-Jiang-Xiao-Shan-Lu-Shu, F2 SMA-4 x A1-97, F2 (2005) A1-97 x A2-47, F2 (1999) Gt x Gr, F2 (2004) Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-a (2003) Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-n (2003) Ref_map  
Legend: Correspondences (Corresponding Maps)
Wed Jul 12, 2006
Disclaimers 		Contact CottonDB Curator