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Welcome to the Matrix

Each cell in the matrix shows the number of correspondences (and maps) between each pair. A correspondence is any relationship between two features.

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Reference Set Bin Genetic Reference Reference Set
AD:Gh/Gb AD:Gb/Gh AD:Gh/Gb AD:Gh/Gh AD:Gh/Gto A:Gar/Gar A:Gar/Ghe A:Ghe/Gar D:Gtr/Gra G:Gne/Gau AD:Ref_Map
  Monsanto SSR Bin Map 3-79 x NM-24016, RIL (2008) Hai-7124 x Junmian-1, BC1 (2008) Hai-7124 x Junmian-1, F2 (2008) Pima S-7 x Empire, F2 (2007) Pima S-7 x im, F2 (2007) Pima S-7 x n2, F2 (2007) Acala-44 x Pima S-7, F2 (2004) CCRI-36 x Hai-7124 ,F2 (2007) CAMD-E x Seaberry, F2 (1998) Deltapine x Giza-83, F2 (2008) Deltapine-61 x Seaberry, F2 (2000) Emian-22 x 3-79, BC1 (2008) Guazuncho-2 x VH8-4602, BC1 (2005) Guazuncho-2 x VH8-4602, BC2 (2006) Handan-208 x Pima-90, F2 (2007) Palmeri x K-101, F2 (2007) Sic'on x F-177, F2 (2004) TM-1 x 3-79, RIL (2006) TM-1 x Hai-7124, BC1 (2007) Tamcot-2111 x Pima S-6, BC3F2 (2005) Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2002) Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2005) Xinluzao-1 x Hai-7124, F2 (2008) 7235 x TM-1, RIL (2007) DES 119-5 x MD51ne, F2,3 (2002) Deltapine-61 x Texas-701, F2 (2007) HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) HS-46 x MARCABUCAG8US-1-88, F2,3 (1998) MD-5678ne x Prema, F2,3 (2000) (Simian-3 x Sumian-12) x (Zhong-4133 x 8891), 4WC (2008) Yumian-1 x T586, F2:3 (2005) Zhongmiansuo-12 x 8891, RIL (2007) TM-1 x WT-936, F2 (2005) Jiang-Ling-Zhong-Mian x Zhe-Jiang-Xiao-Shan-Lu-Shu, F2 SMA-4 x A1-97, F2 (2005) A1-97 x A2-47, F2 (1999) Gt x Gr, F2 (2004) Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-a (2003) Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-n (2003) Ref_map  
Genetic AD:Gb/Gh
Pima S-7 x im, F2 (2007) 		PimaS6xim-F2_chr01 - - - - 5(2) 12(7) 24(6) 1(1) - 3(2) - 6(3) - 3(2) - - 40(8) 6(3) - - 33(7) - - - - - - - - - - - - 11(5) - 4(4) 1(1) 3(2) - - - PimaS6xim-F2_chr01 AD:Gb/Gh
Pima S-7 x im, F2 (2007) 		Genetic
PimaS6xim-F2_chr02 - - - - - 7(5) 13(7) - - 1(1) - - - 1(1) - - 20(7) - - - 20(7) - - - - - - - - - - - - 1(1) - - - - - - - PimaS6xim-F2_chr02
PimaS6xim-F2_chr03 - - - - 4(2) 11(9) 27(10) - - 5(2) - 5(3) - 5(4) - - 29(11) 8(4) - - 28(11) - - - - - - - - - - - - 12(6) - 2(2) - 3(2) - - - PimaS6xim-F2_chr03
PimaS6xim-F2_chr04 - - - - 1(1) 5(4) 8(2) - - 1(1) - 4(3) - 1(1) - - 15(5) 3(2) - - 14(4) - - - - - - - - - - - - 6(4) - 6(4) 1(1) - - - - PimaS6xim-F2_chr04
PimaS6xim-F2_chr05 - - - - 1(1) 6(5) 9(5) - - 5(4) - 1(1) - 2(2) - - 14(9) - - - 14(9) - - - - - - - - - - - - 6(5) - 1(1) 1(1) - - - - PimaS6xim-F2_chr05
PimaS6xim-F2_chr05.1 - - - - 1(1) 14(8) 22(9) - - 9(5) - 2(2) - 1(1) - - 33(12) 3(2) - - 29(12) - - - - - - - - - - - - 5(5) - 1(1) 1(1) 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr05.1
PimaS6xim-F2_chr05.2 - - - - 1(1) - 3(1) - - - - - - 1(1) - - 8(4) - - - 8(4) - - - - - - - - - - - - - - 5(3) - 2(2) - - - PimaS6xim-F2_chr05.2
PimaS6xim-F2_chr06 - - - - 4(3) 5(3) 13(5) - - 2(2) - 2(2) - 3(2) - - 12(4) 4(4) - - 14(4) - - - - - - - - - - - - 8(6) - 2(2) 1(1) 3(2) - - - PimaS6xim-F2_chr06
PimaS6xim-F2_chr07.1 - - - - 4(2) 4(1) 12(2) - - 6(2) - 6(2) - 3(2) - - 12(4) 5(3) - - 12(4) - - - - - - - - - - - - 4(3) - 1(1) 1(1) 2(2) - - - PimaS6xim-F2_chr07.1
PimaS6xim-F2_chr07.2 - - - - 1(1) 4(2) 7(2) - - 1(1) - 1(1) - 3(3) - - 7(3) 2(2) - - 7(3) - - - - - - - - - - - - 6(6) - 1(1) 2(2) 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr07.2
PimaS6xim-F2_chr08/A02 - - - - 2(1) 12(8) 31(9) - - 6(3) - 5(2) - 5(2) - - 34(9) 5(2) - - 31(7) - - - - - - - - - - - - 9(4) - 2(2) - 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr08/A02
PimaS6xim-F2_chr09 - - - - 2(1) 3(1) 8(4) 1(1) - 4(2) - 5(3) - 4(2) - - 8(2) 5(2) - - 8(2) - - - - - - - - - - - - 3(2) - 1(1) 1(1) 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr09
PimaS6xim-F2_chr09.1 - - - - - 2(2) 6(3) - - - - 2(2) - - - - 4(3) 2(2) - - 4(3) - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - PimaS6xim-F2_chr09.1
PimaS6xim-F2_chr10 - - - - 1(1) 3(2) 6(3) - - 2(2) - 2(2) - 1(1) - - 6(3) 1(1) - - 6(3) - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr10
PimaS6xim-F2_chr10.1 - - - - 3(1) 9(5) 13(5) - - 7(5) - 5(3) - 2(2) - - 17(7) 4(2) - - 14(7) - - - - - - - - - - - - 4(4) - 4(2) - 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr10.1
PimaS6xim-F2_chr10.2 - - - - - 2(1) 6(2) - - - - - - 2(1) - - 4(2) - - - 4(2) - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - PimaS6xim-F2_chr10.2
PimaS6xim-F2_chr11/A03 - - - - 1(1) 13(6) 19(6) - - 2(2) - - - 1(1) - - 26(8) - - - 25(8) - - - - - - - - - - - - 1(1) - 8(4) - - - - - PimaS6xim-F2_chr11/A03
PimaS6xim-F2_chr11/A03.1 - - - - 1(1) 4(1) 6(3) - - - - 2(2) - 2(2) - - 5(2) 2(2) - - 5(2) - - - - - - - - - - - - 2(2) - - - - - - - PimaS6xim-F2_chr11/A03.1
PimaS6xim-F2_chr12 - - - - 2(2) 15(10) 39(13) - - 2(2) - 1(1) - 5(3) - - 47(16) 1(1) - - 45(16) - - - - - - - - - - - - 5(4) - 4(3) - 2(1) - - - PimaS6xim-F2_chr12
PimaS6xim-F2_chr13/A01 - - - - 5(2) 16(8) 38(9) - - 6(3) - 7(3) - 6(3) - - 40(9) 8(5) - - 35(6) - - - - - - - - - - - - 7(4) - 4(3) 2(1) 3(1) - - - PimaS6xim-F2_chr13/A01
PimaS6xim-F2_chr14 - - - - 1(1) 4(3) 12(5) - - - - - - 3(2) - - 18(7) 1(1) - - 17(7) - - - - - - - - - - - - 4(3) - 2(1) - 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr14
PimaS6xim-F2_chr15 - - - - - 2(1) 4(2) - - - - - - - - - 5(2) - - - 5(2) - - - - - - - - - - - - 2(1) - - - 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr15
PimaS6xim-F2_chr15.1 - - - - 2(1) 3(3) 3(2) - - 1(1) - 5(2) - 4(2) - - 12(2) 5(2) - - 8(2) - - - - - - - - - - - - 1(1) - 2(1) 2(1) 2(1) - - - PimaS6xim-F2_chr15.1
PimaS6xim-F2_chr15.2 - - - - - 7(5) 12(5) - - 1(1) - - - 1(1) - - 13(5) 1(1) - - 13(5) - - - - - - - - - - - - 5(4) - - - 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr15.2
PimaS6xim-F2_chr16 - - - - 1(1) 9(4) 23(6) - - 6(2) - 4(2) - 5(2) - - 22(6) 6(3) - - 20(6) - - - - - - - - - - - - 5(3) - 2(1) 3(3) 3(2) - - - PimaS6xim-F2_chr16
PimaS6xim-F2_chr17 - - - - - 1(1) 3(2) - - 2(1) - 2(1) - 2(2) - - 3(2) 1(1) - - 3(2) - - - - - - - - - - - - 1(1) - - - - - - - PimaS6xim-F2_chr17
PimaS6xim-F2_chr17.1 - - - - - - 2(1) - - 1(1) - 1(1) - 1(1) - - 4(4) 1(1) - - 4(4) - - - - - - - - - - - - 1(1) - - - - - - - PimaS6xim-F2_chr17.1
PimaS6xim-F2_chr17.2 - - - - 2(2) 4(3) 9(4) - - 4(3) - 3(3) - 3(2) - - 12(5) 3(3) - - 12(5) - - - - - - - - - - - - 5(3) - - - 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr17.2
PimaS6xim-F2_chr18 - - - - 1(1) 12(4) 25(7) - - 2(2) - 2(2) - 3(2) - - 22(6) 2(2) - - 19(6) - - - - - - - - - - - - 1(1) - - 1(1) 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr18
PimaS6xim-F2_chr19/D08 - - - - 4(3) 19(10) 40(10) - - 9(3) - 3(2) - 1(1) - - 50(14) 3(3) - - 47(13) - - - - - - - - - - - - 19(10) - 18(5) 7(3) 4(2) - - - PimaS6xim-F2_chr19/D08
PimaS6xim-F2_chr20 - - - - 3(2) 7(3) 30(4) - - 4(4) - 5(2) - 3(3) - - 38(6) 3(2) - - 27(6) - - - - - - - - - - - - 4(4) - 3(2) 1(1) 3(1) - - - PimaS6xim-F2_chr20
PimaS6xim-F2_chr21/D02 - - - - 3(1) 40(17) 47(13) - - 13(5) - 5(4) - 6(4) - - 64(14) 4(4) - - 63(14) - - - - - - - - - - - - 17(8) - 4(2) 1(1) 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr21/D02
PimaS6xim-F2_chr22 - - - - 1(1) 12(9) 16(8) - - 6(4) - 4(4) - 4(4) - - 30(14) 3(3) - - 26(14) - - - - - - - - - - - - 7(6) - 5(2) 1(1) 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr22
PimaS6xim-F2_chr23 - - - - 3(1) 14(9) 18(10) - - 4(2) - 7(2) - 4(2) - - 28(9) 7(2) - - 26(9) - - - - - - - - - - - - 5(4) - 2(2) - - - - - PimaS6xim-F2_chr23
PimaS6xim-F2_chr24/D03 - - - - 2(2) 4(3) 11(4) 1(1) - 4(1) - 2(1) - 1(1) - - 14(6) 3(2) - - 13(5) - - - - - - - - - - - - 5(2) - 3(2) 1(1) 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr24/D03
PimaS6xim-F2_chr24/D03.1 - - - - - 4(1) 7(2) - - 1(1) - 1(1) - 2(2) - - 8(2) 1(1) - - 8(2) - - - - - - - - - - - - 2(2) - - - - - - - PimaS6xim-F2_chr24/D03.1
PimaS6xim-F2_chr25 - - - - 1(1) 2(1) 5(3) - - - - - - - - - 4(3) - - - 6(3) - - - - - - - - - - - - 2(2) - - - 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr25
PimaS6xim-F2_chr25.1 - - - - 2(2) 3(2) 8(3) - - 2(2) - 2(2) - 3(3) - - 10(4) 3(3) - - 10(4) - - - - - - - - - - - - 3(2) - 1(1) 1(1) 1(1) - - - PimaS6xim-F2_chr25.1
PimaS6xim-F2_chr26 - - - - 1(1) 16(9) 28(11) - - 2(2) - 1(1) - 3(2) - - 37(14) 2(2) - - 36(14) - - - - - - - - - - - - 6(6) - 6(4) 1(1) 3(1) - - - PimaS6xim-F2_chr26
  Monsanto SSR Bin Map 3-79 x NM-24016, RIL (2008) Hai-7124 x Junmian-1, BC1 (2008) Hai-7124 x Junmian-1, F2 (2008) Pima S-7 x Empire, F2 (2007) Pima S-7 x im, F2 (2007) Pima S-7 x n2, F2 (2007) Acala-44 x Pima S-7, F2 (2004) CCRI-36 x Hai-7124 ,F2 (2007) CAMD-E x Seaberry, F2 (1998) Deltapine x Giza-83, F2 (2008) Deltapine-61 x Seaberry, F2 (2000) Emian-22 x 3-79, BC1 (2008) Guazuncho-2 x VH8-4602, BC1 (2005) Guazuncho-2 x VH8-4602, BC2 (2006) Handan-208 x Pima-90, F2 (2007) Palmeri x K-101, F2 (2007) Sic'on x F-177, F2 (2004) TM-1 x 3-79, RIL (2006) TM-1 x Hai-7124, BC1 (2007) Tamcot-2111 x Pima S-6, BC3F2 (2005) Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2002) Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2005) Xinluzao-1 x Hai-7124, F2 (2008) 7235 x TM-1, RIL (2007) DES 119-5 x MD51ne, F2,3 (2002) Deltapine-61 x Texas-701, F2 (2007) HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) HS-46 x MARCABUCAG8US-1-88, F2,3 (1998) MD-5678ne x Prema, F2,3 (2000) (Simian-3 x Sumian-12) x (Zhong-4133 x 8891), 4WC (2008) Yumian-1 x T586, F2:3 (2005) Zhongmiansuo-12 x 8891, RIL (2007) TM-1 x WT-936, F2 (2005) Jiang-Ling-Zhong-Mian x Zhe-Jiang-Xiao-Shan-Lu-Shu, F2 SMA-4 x A1-97, F2 (2005) A1-97 x A2-47, F2 (1999) Gt x Gr, F2 (2004) Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-a (2003) Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-n (2003) Ref_map  
Legend: Correspondences (Corresponding Maps)
Wed Jul 12, 2006
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