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Welcome to the Matrix
Each cell in the matrix shows the number of correspondences (and maps) between each pair. A correspondence is any relationship between two features.
| Reference Set | Bin | Genetic | Reference | Reference Set | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AD:Gh/Gb | AD:Gb/Gh | AD:Gh/Gb | AD:Gh/Gh | AD:Gh/Gto | A:Gar/Gar | A:Gar/Ghe | A:Ghe/Gar | D:Gtr/Gra | G:Gne/Gau | AD:Ref_Map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monsanto SSR Bin Map | 3-79 x NM-24016, RIL (2008) | Hai-7124 x Junmian-1, BC1 (2008) | Hai-7124 x Junmian-1, F2 (2008) | Pima S-7 x Empire, F2 (2007) | Pima S-7 x im, F2 (2007) | Pima S-7 x n2, F2 (2007) | Acala-44 x Pima S-7, F2 (2004) | CCRI-36 x Hai-7124 ,F2 (2007) | CAMD-E x Seaberry, F2 (1998) | Deltapine x Giza-83, F2 (2008) | Deltapine-61 x Seaberry, F2 (2000) | Emian-22 x 3-79, BC1 (2008) | Guazuncho-2 x VH8-4602, BC1 (2005) | Guazuncho-2 x VH8-4602, BC2 (2006) | Handan-208 x Pima-90, F2 (2007) | Palmeri x K-101, F2 (2007) | Sic'on x F-177, F2 (2004) | TM-1 x 3-79, RIL (2006) | TM-1 x Hai-7124, BC1 (2007) | Tamcot-2111 x Pima S-6, BC3F2 (2005) | Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2002) | Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2005) | Xinluzao-1 x Hai-7124, F2 (2008) | 7235 x TM-1, RIL (2007) | DES 119-5 x MD51ne, F2,3 (2002) | Deltapine-61 x Texas-701, F2 (2007) | HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) | HS-46 x MARCABUCAG8US-1-88, F2,3 (1998) | MD-5678ne x Prema, F2,3 (2000) | (Simian-3 x Sumian-12) x (Zhong-4133 x 8891), 4WC (2008) | Yumian-1 x T586, F2:3 (2005) | Zhongmiansuo-12 x 8891, RIL (2007) | TM-1 x WT-936, F2 (2005) | Jiang-Ling-Zhong-Mian x Zhe-Jiang-Xiao-Shan-Lu-Shu, F2 | SMA-4 x A1-97, F2 (2005) | A1-97 x A2-47, F2 (1999) | Gt x Gr, F2 (2004) | Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-a (2003) | Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-n (2003) | Ref_map | ||||||
| Genetic | AD:Gb/Gh Pima S-7 x Empire, F2 (2007) |
Pima-S7xEmpire-F2_chr01 | - | - | - | - | - | 5(3) | 5(3) | 2(1) | - | 4(1) | - | 3(2) | - | 4(2) | - | - | 10(4) | 7(3) | - | - | 8(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(4) | - | - | - | 1(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr01 | AD:Gb/Gh Pima S-7 x Empire, F2 (2007) | Genetic |
| Pima-S7xEmpire-F2_chr02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 3(2) | - | 1(1) | - | - | 3(2) | 4(2) | - | - | 3(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(2) | - | 1(1) | - | - | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr02 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr03 | - | - | - | - | - | 4(2) | 5(3) | - | - | 4(1) | - | 2(2) | - | 3(2) | - | - | 7(2) | 4(2) | - | - | 5(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(3) | - | - | - | 2(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr03 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr04 | - | - | - | - | - | 2(1) | 2(1) | 2(1) | - | 8(3) | - | 5(3) | - | 2(2) | - | - | 9(4) | 5(3) | - | - | 7(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5(4) | - | 5(4) | 2(1) | 2(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr04 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr05 | - | - | - | - | - | 2(2) | 2(1) | - | - | 3(3) | - | 4(2) | - | 4(4) | - | - | 12(3) | 4(1) | - | - | 10(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(3) | - | 4(1) | 1(1) | 2(2) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr05 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr06 | - | - | - | - | - | 4(3) | 4(3) | - | - | 4(3) | - | 3(2) | - | 5(3) | - | - | 9(4) | 4(2) | - | - | 11(4) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3(3) | - | 1(1) | - | 1(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr06 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr07 | - | - | - | - | - | 5(3) | 6(3) | - | - | 13(3) | - | 3(2) | - | 6(4) | - | - | 10(4) | 6(3) | - | - | 9(4) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(4) | - | 4(2) | 1(1) | 8(3) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr07 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr08/lgA02 | - | - | - | - | - | 3(2) | 4(3) | - | - | 10(2) | - | 11(3) | - | 7(2) | - | - | 13(2) | 9(2) | - | - | 12(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7(5) | - | - | 1(1) | 2(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr08/lgA02 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr09 | - | - | - | - | - | 2(1) | 2(1) | 1(1) | - | 4(2) | - | 5(3) | - | 5(2) | - | - | 9(3) | 4(3) | - | - | 6(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | 1(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr09 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr10 | - | - | - | - | - | 5(3) | 5(3) | - | - | 5(3) | - | 6(2) | - | 3(2) | - | - | 8(2) | 4(2) | - | - | 7(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 2(2) | 1(1) | 3(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr10 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr10/20 | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | 3(3) | - | 1(1) | - | 1(1) | - | - | 2(2) | 1(1) | - | - | 2(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 1(1) | - | - | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr10/20 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr11/lgA03.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(2) | - | 1(1) | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr11/lgA03.1 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr11/lgA03.2 | - | - | - | - | - | 2(2) | 1(1) | - | - | 1(1) | - | 3(1) | - | 1(1) | - | - | 5(2) | 3(2) | - | - | 5(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(2) | - | 1(1) | 2(1) | 3(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr11/lgA03.2 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr12.1 | - | - | - | - | - | 2(2) | 3(3) | - | - | 4(1) | - | 3(1) | - | 2(1) | - | - | 4(3) | 4(3) | - | - | 5(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(4) | - | - | - | 3(3) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr12.1 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr12.2 | - | - | - | - | - | 1(1) | 1(1) | - | - | 2(2) | - | - | - | 1(1) | - | - | 3(2) | - | - | - | 2(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(2) | - | - | - | - | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr12.2 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr13/lgA01 | - | - | - | - | - | 6(3) | 3(3) | - | - | 8(2) | - | 6(1) | - | 3(2) | - | - | 10(4) | 7(2) | - | - | 10(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(3) | - | 1(1) | - | 1(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr13/lgA01 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr14 | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 9(2) | - | 10(2) | - | 11(3) | - | - | 16(4) | 13(3) | - | - | 15(4) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 6(3) | - | 7(2) | 1(1) | 8(2) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr14 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr15 | - | - | - | - | - | 2(1) | 1(1) | - | - | 2(1) | - | 6(2) | - | 3(2) | - | - | 6(2) | 4(2) | - | - | 4(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(2) | - | - | - | 1(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr15 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr16 | - | - | - | - | - | 1(1) | 1(1) | - | - | 3(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr16 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr17 | - | - | - | - | - | 1(1) | 1(1) | - | - | 4(1) | - | 1(1) | - | 2(2) | - | - | 3(1) | 2(1) | - | - | 4(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr17 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr18 | - | - | - | - | - | 3(2) | 7(5) | - | - | 6(2) | - | 4(2) | - | 3(2) | - | - | 7(2) | 5(2) | - | - | 5(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr18 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr19/lgD08.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 6(3) | - | 4(3) | - | 2(2) | - | - | 9(2) | 3(2) | - | - | 8(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 1(1) | 1(1) | 1(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr19/lgD08.1 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr19/lgD08.2 | - | - | - | - | - | 2(2) | 1(1) | - | - | 4(2) | - | 2(1) | - | 1(1) | - | - | 5(2) | 4(2) | - | - | 5(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3(2) | - | - | - | 2(2) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr19/lgD08.2 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr19/lgD08.3 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(2) | - | 5(1) | - | 1(1) | - | - | 3(1) | 5(2) | - | - | 5(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(2) | - | - | 1(1) | - | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr19/lgD08.3 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr20 | - | - | - | - | - | 2(1) | 2(1) | - | - | 3(2) | - | 3(1) | - | 2(1) | - | - | 5(2) | 4(2) | - | - | 4(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(3) | - | - | 1(1) | 2(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr20 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr21/lgD02 | - | - | - | - | - | 4(2) | 2(1) | - | - | 12(5) | - | 6(3) | - | 4(2) | - | - | 11(3) | 6(3) | - | - | 11(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3(2) | - | - | 1(1) | 2(2) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr21/lgD02 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr22 | - | - | - | - | - | 1(1) | 1(1) | - | - | 2(1) | - | 2(2) | - | 2(2) | - | - | 5(3) | 1(1) | - | - | 4(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 2(1) | - | - | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr22 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr23 | - | - | - | - | - | 3(1) | 2(2) | - | - | 3(1) | - | 5(2) | - | 2(2) | - | - | 10(2) | 4(2) | - | - | 7(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(2) | - | 3(3) | - | 3(2) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr23 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr24/lgD03 | - | - | - | - | - | 1(1) | 1(1) | 2(2) | - | 4(1) | - | 3(2) | - | 3(3) | - | - | 7(3) | 5(4) | - | - | 6(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 1(1) | 1(1) | 1(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr24/lgD03 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr25 | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 1(1) | - | 8(3) | - | 5(1) | - | 3(2) | - | - | 9(3) | 5(2) | - | - | 9(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4(2) | - | - | - | 2(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr25 | ||||
| Pima-S7xEmpire-F2_chr26 | - | - | - | - | - | 1(1) | 1(1) | - | - | 7(2) | - | 2(2) | - | 2(2) | - | - | 6(1) | 3(2) | - | - | 5(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3(2) | - | 1(1) | 1(1) | 3(1) | - | - | - | Pima-S7xEmpire-F2_chr26 | ||||
| Monsanto SSR Bin Map | 3-79 x NM-24016, RIL (2008) | Hai-7124 x Junmian-1, BC1 (2008) | Hai-7124 x Junmian-1, F2 (2008) | Pima S-7 x Empire, F2 (2007) | Pima S-7 x im, F2 (2007) | Pima S-7 x n2, F2 (2007) | Acala-44 x Pima S-7, F2 (2004) | CCRI-36 x Hai-7124 ,F2 (2007) | CAMD-E x Seaberry, F2 (1998) | Deltapine x Giza-83, F2 (2008) | Deltapine-61 x Seaberry, F2 (2000) | Emian-22 x 3-79, BC1 (2008) | Guazuncho-2 x VH8-4602, BC1 (2005) | Guazuncho-2 x VH8-4602, BC2 (2006) | Handan-208 x Pima-90, F2 (2007) | Palmeri x K-101, F2 (2007) | Sic'on x F-177, F2 (2004) | TM-1 x 3-79, RIL (2006) | TM-1 x Hai-7124, BC1 (2007) | Tamcot-2111 x Pima S-6, BC3F2 (2005) | Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2002) | Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2005) | Xinluzao-1 x Hai-7124, F2 (2008) | 7235 x TM-1, RIL (2007) | DES 119-5 x MD51ne, F2,3 (2002) | Deltapine-61 x Texas-701, F2 (2007) | HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) | HS-46 x MARCABUCAG8US-1-88, F2,3 (1998) | MD-5678ne x Prema, F2,3 (2000) | (Simian-3 x Sumian-12) x (Zhong-4133 x 8891), 4WC (2008) | Yumian-1 x T586, F2:3 (2005) | Zhongmiansuo-12 x 8891, RIL (2007) | TM-1 x WT-936, F2 (2005) | Jiang-Ling-Zhong-Mian x Zhe-Jiang-Xiao-Shan-Lu-Shu, F2 | SMA-4 x A1-97, F2 (2005) | A1-97 x A2-47, F2 (1999) | Gt x Gr, F2 (2004) | Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-a (2003) | Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-n (2003) | Ref_map | ||||||