|
|
|
| Home | Browse CottonDB | Quick Queries | FPC Viewer | Genome Browser | BLAST Server | | Map Summaries | Maps | Feature Search | Matrix | Map Sets | Species | Help | Tutorial |
|
Welcome to the Matrix
Each cell in the matrix shows the number of correspondences (and maps) between each pair. A correspondence is any relationship between two features.
| Reference Set | Bin | Genetic | Reference | Reference Set | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AD:Gh/Gb | AD:Gb/Gh | AD:Gh/Gb | AD:Gh/Gh | AD:Gh/Gto | A:Gar/Gar | A:Gar/Ghe | A:Ghe/Gar | D:Gtr/Gra | G:Gne/Gau | AD:Ref_Map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monsanto SSR Bin Map | 3-79 x NM-24016, RIL (2008) | Hai-7124 x Junmian-1, BC1 (2008) | Hai-7124 x Junmian-1, F2 (2008) | Pima S-7 x Empire, F2 (2007) | Pima S-7 x im, F2 (2007) | Pima S-7 x n2, F2 (2007) | Acala-44 x Pima S-7, F2 (2004) | CCRI-36 x Hai-7124 ,F2 (2007) | CAMD-E x Seaberry, F2 (1998) | Deltapine x Giza-83, F2 (2008) | Deltapine-61 x Seaberry, F2 (2000) | Emian-22 x 3-79, BC1 (2008) | Guazuncho-2 x VH8-4602, BC1 (2005) | Guazuncho-2 x VH8-4602, BC2 (2006) | Handan-208 x Pima-90, F2 (2007) | Palmeri x K-101, F2 (2007) | Sic'on x F-177, F2 (2004) | TM-1 x 3-79, RIL (2006) | TM-1 x Hai-7124, BC1 (2007) | Tamcot-2111 x Pima S-6, BC3F2 (2005) | Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2002) | Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2005) | Xinluzao-1 x Hai-7124, F2 (2008) | 7235 x TM-1, RIL (2007) | DES 119-5 x MD51ne, F2,3 (2002) | Deltapine-61 x Texas-701, F2 (2007) | HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) | HS-46 x MARCABUCAG8US-1-88, F2,3 (1998) | MD-5678ne x Prema, F2,3 (2000) | (Simian-3 x Sumian-12) x (Zhong-4133 x 8891), 4WC (2008) | Yumian-1 x T586, F2:3 (2005) | Zhongmiansuo-12 x 8891, RIL (2007) | TM-1 x WT-936, F2 (2005) | Jiang-Ling-Zhong-Mian x Zhe-Jiang-Xiao-Shan-Lu-Shu, F2 | SMA-4 x A1-97, F2 (2005) | A1-97 x A2-47, F2 (1999) | Gt x Gr, F2 (2004) | Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-a (2003) | Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-n (2003) | Ref_map | ||||||
| Genetic | AD:Gh/Gh HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) |
HQM-F2.3_group01 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group01 | AD:Gh/Gh HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) | Genetic |
| HQM-F2.3_group02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group02 | ||||
| HQM-F2.3_group03 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group03 | ||||
| HQM-F2.3_group04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(1) | - | - | 5(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group04 | ||||
| HQM-F2.3_group05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group05 | ||||
| HQM-F2.3_group06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group06 | ||||
| HQM-F2.3_group07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | 5(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group07 | ||||
| HQM-F2.3_group08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group08 | ||||
| HQM-F2.3_group09 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | 2(1) | - | - | 1(1) | - | 1(1) | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group09 | ||||
| HQM-F2.3_group10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | 2(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group10 | ||||
| HQM-F2.3_group11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group11 | ||||
| HQM-F2.3_group12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group12 | ||||
| HQM-F2.3_group13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group13 | ||||
| HQM-F2.3_group14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3(1) | - | - | 2(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group14 | ||||
| HQM-F2.3_group15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group15 | ||||
| HQM-F2.3_group16 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group16 | ||||
| HQM-F2.3_group17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group17 | ||||
| HQM-F2.3_group18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group18 | ||||
| HQM-F2.3_group19 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3(1) | - | 1(1) | 6(2) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group19 | ||||
| HQM-F2.3_group20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group20 | ||||
| HQM-F2.3_group21 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group21 | ||||
| HQM-F2.3_group22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | - | 1(1) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group22 | ||||
| HQM-F2.3_group23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1(1) | - | 1(1) | 10(3) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group23 | ||||
| HQM-F2.3_group24 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | HQM-F2.3_group24 | ||||
| Monsanto SSR Bin Map | 3-79 x NM-24016, RIL (2008) | Hai-7124 x Junmian-1, BC1 (2008) | Hai-7124 x Junmian-1, F2 (2008) | Pima S-7 x Empire, F2 (2007) | Pima S-7 x im, F2 (2007) | Pima S-7 x n2, F2 (2007) | Acala-44 x Pima S-7, F2 (2004) | CCRI-36 x Hai-7124 ,F2 (2007) | CAMD-E x Seaberry, F2 (1998) | Deltapine x Giza-83, F2 (2008) | Deltapine-61 x Seaberry, F2 (2000) | Emian-22 x 3-79, BC1 (2008) | Guazuncho-2 x VH8-4602, BC1 (2005) | Guazuncho-2 x VH8-4602, BC2 (2006) | Handan-208 x Pima-90, F2 (2007) | Palmeri x K-101, F2 (2007) | Sic'on x F-177, F2 (2004) | TM-1 x 3-79, RIL (2006) | TM-1 x Hai-7124, BC1 (2007) | Tamcot-2111 x Pima S-6, BC3F2 (2005) | Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2002) | Vgs x (TM-1 x Hai-7124), DH (2005) | Xinluzao-1 x Hai-7124, F2 (2008) | 7235 x TM-1, RIL (2007) | DES 119-5 x MD51ne, F2,3 (2002) | Deltapine-61 x Texas-701, F2 (2007) | HQ95-6 x MD51ne, F2,3 (2002) | HS-46 x MARCABUCAG8US-1-88, F2,3 (1998) | MD-5678ne x Prema, F2,3 (2000) | (Simian-3 x Sumian-12) x (Zhong-4133 x 8891), 4WC (2008) | Yumian-1 x T586, F2:3 (2005) | Zhongmiansuo-12 x 8891, RIL (2007) | TM-1 x WT-936, F2 (2005) | Jiang-Ling-Zhong-Mian x Zhe-Jiang-Xiao-Shan-Lu-Shu, F2 | SMA-4 x A1-97, F2 (2005) | A1-97 x A2-47, F2 (1999) | Gt x Gr, F2 (2004) | Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-a (2003) | Gos-5024 x Hyb 601-2, F2-n (2003) | Ref_map | ||||||